Génomique des algues vertes et de leurs virus

Les algues vertes (Chlorophyte) forment un groupe d'organismes eukaryotes photosynthétiques le plus souvent unicellulaires au sein duquel ont émergé les plantes terrestres. Depuis le séquençage initial de Chlamydomonas reinhardtii terminé en 2007, la génomique des algues vertes a fortement accéléré puisque à l'heure actuelle, pas moins 10 espèces de Chlorophyte ont leur génome entièrement séquencé. Notre équipe a activement participé à trois de ces projets. Je reviendrai donc ici sur nos trois dernieres années d'immersion dans le monde des algues vertes et de leurs génomes en présentant des données comparatives qui révèlent une grande variabilité dans leurs métabolismes et l'organisation de l'information génétique, bien loin de ce que laissait présager naïvement leur morphologie de "simple petit rond vert". Les algues vertes sont aussi infectés par de grands virus à ADN double brin, les phycoDNAvirus. Ces derniers jouent probablement un très grand rôle dans le contrôle des populations algales. Je présenterai quelques résultats préliminaires de deux projets connexes, l'un concernant la transcriptomique haut-débit de l'infection de la chlorelle par son virus PBCV-1, l'autre sur le séquençage génomique de 50 souches indépendantes de virus de chlorelle.